用了两个月, 新阳基地才搬迁到首府。而这两个月中的五十多天都是在做搬迁准备，如寻找能开的车，收集燃油之类。在这段时间里，基地几乎没有受到变异人袭击。这也证实了c市上顺街的这群变异人确实操控着新阳市附近的所有变异人。
这段时间除了新阳基地搬迁, 凤山基地也用了一个月搬到首府。而到凤山围剿变异人的队伍还带了活的七级变异人回基地。
七级变异人没有交给研究院, 而是交给了部队。但基地官方对此很是隐晦, 研究院也是闭口不谈, 赵曦他们也是在研究院找他们采集与七级变异人接触细节时猜到了一些东西, 还被提醒说关于七级变异人的事现在不要外传。
此外，基地派到m省去寻找幸存者的队伍也有了回音：幸存者基地被找到, 在赵曦他们遇到丁卫国的那个湖泊西北方向的群山里, 大概有十一万人。
那边的七级变异人很难缠, 它们和其他地方的变异人不同, 没有固定的聚集地, 而是像打游击一样时常更换地方。又因为是在山里面, 很多地方车辆到不了, 这给派去消灭它们的队伍带去了很大的麻烦。后来基地发了狠，派了一万人的队伍过去, 一座山一座山的地毯式搜索, 一直折腾了四个月，温度下降到零下四十度时才收工。
这四个月的变异人清理还是有效的, m省基地的人也顺利搬迁到了首府，并且没有把变异人带过来。不过到那里消灭变异人的队伍私下说，他们觉得其实七级变异人不是被他们消灭了, 而是自己看到首府这种必须消灭你们的决心后，感觉没必要硬抗跑了。
而在新阳基地搬迁期间，赵曦他们去了j省寻找幸存者, 并且在j省西北片区寻找到了三个幸存者基地，一共五十多万人口。只是韩秦他们牵挂着的齐教官并没有音讯。
后来每年温度上升时，到外面寻找幸存者成了赵曦他们例行动作。而基地从末世后第三年起也每年都会发布寻找幸存者的任务，除了赵曦他们，也有不少其他的佣兵队接了任务出去。
赵曦他们从j省回来后没多久，基地宣布“a蛋白”进入小范围临床使用。又过了半年“a蛋白”的使用对全基地开放，但由于不同人对抗过敏药物的敏感度不同，“a蛋白”只能解决八成人的体内病毒累计问题。“k细胞”的研发成为这段时间最重要的研究课题。
年底，孙敏生下了一个健康的女孩儿，这是基地出生的第一个孩子。另外一个孕妇却是在怀孕六个月时流产，并且差点一尸两命，基地一时也没法分辨流产是病毒的原因还是a蛋白的原因。但不管怎么说，孙敏孩子的出生意味着“a蛋白”对孕妇和胎儿也有作用。而新生儿的出现让整个基地都感觉到新的时代的到来和人类延续的希望。
但为了确保孕妇的安全，基地并没有马上开始鼓励生育。而是又过了一年，在此期间怀孕的孕妇约有四分之三成功生下孩子，并且没有孕妇死亡后，基地才推出了鼓励生育的各项政策。
末世第三年，基地里有了小型的金属冶炼厂、石油炼制产业链、一些急缺的低温下运行的机器的生产企业，以及另外一些轻工业，应该说基地的工业在逐渐恢复。而农业方面，基地一号区北边原本就有大片的田地，现在完全被使用了起来，建成温室大棚种植末世后发现的植物和养殖目前已经被驯化的田鼠。而田鼠肉和最早被发现的土豆和平菇开始限量给整个基地供应。
“k细胞”研究院已经可以培育，但到底怎么使用还没有头绪。研究员做了三次临床试验，口服、注射、雾化吸入，各种计量都做了实验。最终实验结果有两点：其一，仅注射有效，其二，“k细胞”少量使用的致病，足量的使用致命。
就像唐永德和赵曦说过的那样：病毒已经和人体细胞结合，成为人体不可分割的一部分。而k细胞进入人体后，它无法分辨病毒处于何种