在他父亲、老师的影响下，也参加了抗清斗争。
　　靠几个读书人去抗击清军是不行的。夏允彝有个学生吴志葵，在吴淞做总兵，手下还有一些兵士。他们去说服吴志葵一起抗清，吴志葵同意了，但不久就被清军打败。
　　清军围攻松江的时候，夏允彝父子和陈子龙冲出清军包围，到乡下隐蔽起来。清军到处搜捕他们，还想引诱夏允彝也来自首。夏允彝不愿落在清兵手里，便投河自杀了。他留下遗嘱，让夏完淳继承他的抗遗志。
　　父亲的牺牲使夏完淳悲痛万分，更激起了他对清朝的仇恨。
　　过了一年，陈子龙秘密策动清朝的松江提督吴胜兆反清。这次兵变又失败了，吴胜兆被杀害，陈子龙也被捕自杀。
　　后来，夏完淳因为叛徒告密，也被捕了，清军派重兵把他押到南京。
　　夏完淳在监狱里被关押了80天。他给亲友写了许多可歌可泣的诗篇和书信，死亡的威胁并没有吓倒他，他感到伤心的是没有实现保卫民族、恢复中原的壮志。
　　对夏完淳的审讯开始了，主持审讯的正是招抚江南的洪承畴。洪承畴得知夏完淳是江南出名的“神童”，就想用软化的手段使他归服。
　　洪承畴露出一副温和的神态说：“我看你小小年纪，未必会起兵造反，一定是受人指使。只要你肯归顺大清，我保你做官。”
　　夏完淳装作不知道上面坐的是洪承畴，厉声说：“我听说我朝有个洪亨九（洪承畴）先生，是豪杰，当年松山一战，他以身殉国，震惊中华。我钦佩他的忠烈，我年纪虽然小，但是杀身报国，怎么了能落在他的后面。”
　　还番话把洪承畴说得哭笑不得，满头是汗。旁边的兵士真的以为夏完淳不认识洪承畴，提醒说：“别胡说，上面坐的就是洪大人。”
　　夏完淳“呸”了一声说：“天下谁不知道洪先生为国牺牲这件事。崇祯帝曾经亲自设祭，满朝官员都为他痛苦哀悼。你们这些叛徒怎敢冒充先烈，侮辱忠魂！”说完，他指着洪承畴骂个不停。洪承畴被骂得面无血色，不敢再审问下去，慌忙叫兵士把夏完淳拉出去。
　　1647年农历九月，这位年仅17岁的少年英雄在南京西市被害。他的朋友把他的尸体运回松江，葬在他父亲墓旁。