时间来到初平元年（公元190年）三月初五日，献帝的车驾到达长安城，先被安置在京兆尹的府上，等到宫殿整修完毕，才搬入宫中。
此时董卓还留在洛阳坐镇，而长安朝堂上的大小事务都交由司徒王允负责。王允在外补救缺失，在内为王室筹划，很有大臣的风度，从天子到文武百官，都倚靠王允。
王允对董卓曲意逢迎，让董卓一直信任王允，其实王允早就对董卓起的杀心，正在想法子除去董卓。
董卓从并、凉二州调来到数万的铁骑往洛阳的方向移动，以对抗关东联军，并令其部将东郡太守胡轸为大都护，领骑督吕布及众多步骑校督，还有部将华雄、徐荣、段煨和樊稠各自领兵往司隶边界方向移动，以对抗关东联军。
董卓还滥用权力，征招二十五万民夫，在长安城以西两百五十里处筑城，这是一座属于他自己的城池，不过却是动用公家的资源。
而被征招筑城的民夫有许多都是刚从洛阳来的百姓，在他们刚到长安时，就被通知要去筑城。
有些百姓收到要去筑城消息时，终于忍受不了，因为他们能从洛阳步行来到长安，为了生存或多或少都会吃到人肉，否则根本没有足够的粮食渡过漫长的路途。
他们在步行途中只要谁倒下就吃谁，因此董贼的自私行为彻底引发民怨，有不少被通知要筑城的百姓起身抵抗，不过他们下场就只有一个字，那就是死，千名起事的百姓被处死后，被征招的民夫都配合前去为董卓筑城。
董卓因袁绍的关系，下令将袁氏一门满门抄斩，包括袁绍的叔父太傅袁隗、袁术的大哥太仆袁基，及其袁府男丁五十余口，虽然袁氏一族被杀害，但是汝南袁氏底蕴依然存在，恰好让袁绍捡了大便宜，袁绍自命为汝南袁氏宗族族长，接获袁氏在汝南的资源，这让袁术得知此事后就开始对袁绍感到不满。
当关东联军盟主袁绍获知此事时，对董卓和其底下的部将，率领军集结洛阳时，感到心生畏惧，在得知董卓从并、凉二州调来到数万的铁骑，不久后就会到达时，袁绍已经不知所措。
此时的曹操自告奋勇，带领他底下所有的士兵出战，而张邈拨出部分军队，派部将卫兹率领，随曹操一同进军。
曹操和卫兹的军队进军到经洛阳途中的重要补给站荥阳冶下的汴河，在那里遭遇徐荣率领的敌军。双方经过一日激战，杂牌联军根本不是一般正规军队的对手。
曹操和卫兹的军队惨败，死伤甚多，卫兹、鲍韬阵亡，鲍信负伤。此外，曹操中箭负伤，他的马匹同样中箭受伤，要不是他的堂弟曹洪把自己的马匹让给他撤离现场，恐怕他也可能遭遇不测。
徐荣想趁胜追击进攻酸枣的联军，但徐荣观察到曹操军即使人数上处于劣势也激战了一个白天，设想攻酸枣和这样的一群人作战，恐怕想赢是件艰难的事，于是徐荣放弃进攻，当下撤回荥阳的驻守地方。
负伤的曹操回到酸枣后，见到各路诸侯的人马十多万人，每天只是喝酒聚会，没人图谋进取，曹操先是谴责这些诸侯，后又为这些诸侯拟定作战策略，可没有诸侯采纳曹操的策略，因为和董卓的部队作战会消减兵力，等于削弱自身的实力，因此没人采纳，于是心灰意冷的曹操最先率部下离开。
在曹操离开以后，驻扎在酸枣的诸侯，在粮食吃尽后，兵众四散，开始起了内哄，演变成部队交锋，东郡太守侨瑁被兖州刺史刘岱所杀，酸枣的诸侯联军可以算是不功自破，诸侯们都回了各自的领地。
荆州刺史王叡和孙坚开始起兵北上，由于王叡一向对待孙坚无礼。当王叡起兵讨伐董卓前，声称要先讨伐与自己不和的武陵郡太守曹寅。曹寅怕被杀，便学桥瑁伪造案行使者温毅的檄文交给孙坚，檄文中要求孙坚诛杀王叡。孙坚立即领兵前往王叡处，以坐无所知之罪，逼王叡便吞金自杀。
孙坚带领军队来到富裕的南阳郡时，其太守张咨不打算提供南阳的任何资源给孙坚。于是孙坚先是送牛、酒给张咨，让张咨次日亦上门答