3月15日，当时乌斯藏都指挥使司为噶玛地方政权统治时代，早已经摆脱了大明乌斯藏都指挥使司与法王（当地高僧）共治的政策，由第巴（部落首领～法王）管理政事。

　　而卫藏传佛教宗派噶玛噶举与藏巴汗：噶玛丹迥旺波，对黄教采取压迫摧残的政策，还利用漠西蒙古青海土默特部首领：孛儿只斤·拉尊、漠西蒙古卫拉特准噶尔部首领兼额尔德尼巴图尔珲台吉：绰罗斯·和多和沁，在青海蒙古（朵甘都指挥使司）发生内讧之际。

　　趁机发动了一次反黄教的高潮，致使卫藏五世达赖喇嘛兼色拉寺赤巴：阿旺罗桑嘉措，不得不避往山南。

　　但是黄教当时在卫藏地区和青康（朵甘都指挥使司）一带，甚至漠南蒙古各地也很普遍，经过了藏传佛教格鲁派宗喀巴：罗桑扎巴，以来近180年的发展。

　　早就取得了广大藏族群众的拥护，因此黄教受卫藏传佛宗派：噶玛噶举，的极力压迫下，也不得不采取对抗办法。

　　故而卫藏五世达赖喇嘛兼色拉寺赤巴：阿旺罗桑嘉措、藏传佛教格鲁派（黄教）首领兼四世班禅：罗桑却吉坚赞，两人经过商议后，立即派出了郭隆寺僧人：纤尼、纳切化，两人化装成其他教派僧人。

　　在作为密使携带书信前往卫拉特部蒙古，将密信亲手交给了卫拉特蒙古四部的盟主～卫拉特蒙古和硕特部固始汗：孛儿只斤·图鲁拜唬，要求他迅速入卫藏救援。

　　同时卫拉特蒙古和硕特部固始汗为了扩大疆域争夺西域霸权，还主动出兵与哈萨克汗国进行交战。

　　4月10日，明广鹿岛左参将：尚可喜，率领麾下将领到达后金汗庭盛京城，后金天聪汗：爱新觉罗·皇太极，连忙出城三十里相迎，与去年招待孔、耿两人归降时同样的待遇。

　　为此后金天聪汗还称赞尚参将，懂得达变通权、知明运之倾危，识时势之向背，赏赐了珍宝无数，并发还先前所俘虏的，且能找到的尚氏家族成员共计27人，旋封尚可喜为〈金州卫总兵〉。

　　4月26日，后金天聪汗就命礼部考取知晓；女真、蒙古、汉书，三者为举人，共有16人合格，各赐衣一套，免四丁，宴请于礼部。

　　同时后金天聪汗在盛京城郊外阅兵，参加的有；女真八旗、漠南蒙古二旗、汉军一旗也叫［乌真超哈］既；后金汉军正蓝旗梅勒额真：马光远，麾下统领，总共十一旗兵马。

　　眼下再加上后金都元帅：孔有德、后金水师总兵：耿仲明，麾下的〈天佑军〉与刚刚投降的后金金州卫总兵：尚可喜，麾下的［天助军］也被暂时纳入到汉军一旗乌真超哈当中。

　　如此兵强马壮又得明军重火炮以及水师兵种加持的后金天聪汗，当即在5月11日，下令集合后金大军第二次大举西征，其军队绕开大明帝国山海卫防线，从北面破长城而入。

　　主要目地就是借着西征漠南蒙古察哈尔部之际，顺带收拾一下明军示威。

　　7月初1日，漠南蒙古察哈尔部胡图克图汗：孛儿只斤·林丹汗巴图尔（虎墩兔）因天花病死在了朵甘都指挥使司青海蒙古大草滩上，结束了他叱咤风云的一生。

　　在漠南蒙古察哈尔部胡图克图汗病故后，他的遗孀们以及他的儿子：孛儿只斤·额尔孔果洛额哲，当即就率领余部从青海蒙古大草滩上，装扮成客商渡过明军防区陕西行都指挥使司西宁卫、凉州卫、镇番卫，从而进入河套地区。

　　7月初2日，在后金天聪汗带领下后金镶白旗台吉：爱新觉罗·阿济格，与后金吏部尚书：爱新觉罗·多尔衮、后金正白旗和硕贝勒：爱新觉罗·多铎，等人率军相继从漠南蒙古巴颜珠尔克地区分兵四路进入大明边境。

　　后金大军来到万全都指挥使司龙门守御千户所长城边上开始猛攻，但由于城高防御好，因此没有攻下，就连入塞之后的龙门卫守军也让攻城的后金大军非常吃力。

　　所以后金天聪汗为了保证士气，便下令转而从长安守