下令在全国“焚书”。第二年，秦始皇又进行了坑儒。
　　秦始皇坑儒是由几个方士的畏罪逃亡引起的。
　　随着统一大业的完成，秦始皇祈求长生的欲望越来越强。早在公元前219年，秦始皇东巡，来到齐国故地。齐地的方士徐福投秦始皇所好，告诉秦始皇东海中有蓬莱、方丈、瀛洲三座仙山，并宣称只要挑选数千名童男、童女，乘几十艘大船，带足礼物，便可入海求见仙人。秦始皇竟信以为真，随即按徐福所说的去做，结果徐福率船东渡，却一去不回。
　　后来在公元前215年，秦始皇又派方士卢生去寻找仙人及长生不老的仙药，但是卢生仍旧是空手而归。他还以谎言蒙骗秦始皇说：“臣等寻求仙药，因为有妨碍的东西，所以常常不能遇到。只要皇帝进常秘密出行，居地无人知晓，真人就会到来，长生之药便可求得。”秦始皇对卢生的话信以为真，并说：“朕十分仰慕真人！”还按照卢生的话去做。但是卢生等人还是没有找到仙药，他们知道不可能永远隐瞒欺骗下去，于是便四处散步流言，说仙药求不得是因为秦始皇独断专权，性格暴躁。然后卢生带着骗取到的钱财偷偷地逃离咸阳。
　　秦始皇见卢生等人寻求仙药长久不得，心中生疑，但是因为寻求仙药之事早已天下皆知，而且秦始皇也自称“真人”，所以仍希望会找到仙药。可是，卢生等的出逃使得咸阳百姓议论纷纷，秦始皇知道后，大怒，说：“朕先前收尽天下不用的书，尽毁去；然后召集天下方士儒生，优待他们，以求太平，炼寻仙药，可是徐福等人竟一去不回，卢生等人还在背后诽谤朕，妖言惑众，朕要一一查问卢生在咸阳的同伙。”于是秦始皇下令审讯儒生，这些人互相告发，共查得460人，全部被活埋于咸阳城外的骊山温谷。所以，骊山温谷也叫坑儒谷，据说到现在这个地方的土全部都是红的。
　　秦始皇“焚书坑儒”虽然加强了思想控制，但是，对于中国文化来说，则是一次严重的摧残，标志着封建文化专制主义的到来。